我校创建于1953年1月，校名为华南垦殖局海南分局干部学校，校址设在海口市白沙乡（今海口市白沙坊，后迁至海口市秀英村）。首任校长由海南区党委第一书记、海南行政公署主任、华南垦殖局海南分局局长冯白驹兼任。

1954年3月，学校迁至临高县加来墟办学。在加来办学期间，学校先后易名为海南加来中等农业技术学校、海南热带作物学校、海南第一热带作物学校、广东省农垦热带作物学校、广东农垦海南中等专业学校。

1987年7月，学校迁往海口市现校址。1988年4月海南建省后，学校易名为海南省农垦海口中等专业学校。1998年被海南省人民政府确认为省级重点中专学校，2007年被教育部认定为国家级重点中专学校。

自办学以来，学校先后被评为（授予）海南行政区、广东省和全国文教系统先进单位、全国“五四红旗团委”创建单位、中国大中专学生志愿者暑期“三下乡”社会实践活动先进单位、国家级重点科研德育子课题实验学校、海口市社会治安综合治理先进单位、海南省普通中专毕业生就业工作优秀学校、海南省职业教育先进单位、海南省学习型组织建设先进单位。2011年被中共海南省委、海南省人民政府授予2007——2011年海南省“文明单位”、2021年被评为省“文明校园”。学校先后开设橡胶栽培、会计电算化、旅游酒店管理、计算机应用、电子商务、文秘、平面设计、文化艺术、高尔夫、烹饪等20多个专业。先后培养各类专业毕业生4万多人，培训垦区干部职工4万多人次。

2014年1月，学校成建制整体移交到海南省教育厅，现为海南省教育厅直属中等职业学校。学校开设专业有七个专业，培养模式有职业中专和职业大专（3+2模式）。